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人腫瘤circRNA PCR芯片


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    PCR ARRAY介紹

    PCR ARRAY又稱PCR芯片,運用高通量熒光定量PCR方法,在一張96孔或384孔板上同時對某個信號通路或疾病相關基因的表達量變化進行檢測,芯片上的基因包括了與研究對象有確定關系的基因或者待考證的基因;目前啟因生物針對不同的信號通路和疾病相關基因設計了150多款功能分類PCR芯片,涵蓋生命科學研究的各個領域。

    人腫瘤circRNA PCR芯片介紹

        circRNA 與腫瘤 TNM 分型密切相關。circRNA 通過調控大量信號通路與腫瘤細胞的增殖、凋亡以及轉移密切關聯(lián),另外還能通過細胞外囊泡(e.g. 外泌體,納米微粒)進行轉運,并且circRNA 具有低分子量、較好的穩(wěn)定性與保守性的特點,因此,circRNA 具有作為治療腫瘤的藥物靶點或載體的潛能。啟因生物的人腫瘤circRNA PCR ARRAY含有94個人腫瘤circRNA 相關基因,包含乳腺癌,食管癌,非小細胞肺癌,肝癌,胃癌,膀胱癌,骨肉瘤,膠質瘤等數(shù)十種腫瘤或癌癥類型。

    產品說明

    產品名稱

    腫瘤circRNA PCR芯片

    貨    號

    sp-TWCPAHM-0012

    基因數(shù)目

    94

    基因名稱

    見基因列表

    檢測費用

    1000/

    樣本類型

    細胞,組織等

    項目周期

    2周(不含節(jié)假日)

    實驗結果

    原始數(shù)據(jù),數(shù)據(jù)分析

    技術原理

    *相對定量,SYBR Green

    *相對定量:用于測定一個測試樣本中目標基因與校正樣本中同一基因表達的相對變化。校正樣本可以是一個未經處理的對照或者是在一個實驗研究中處于零時的樣本

    服務特點

    1. 只需提供樣品

    2. 數(shù)據(jù)分析多樣性選擇

    3. 中低通量,一次性檢測多個相關基因的表達水平

    4. 周期短

    5. 結果不需要qPCR驗證

    服務流程

    1. 確定實驗方案,簽合同

    2. 樣品寄出(-80℃順豐寄出)

    3. 收樣后進行質控

    4. 質控過關,上機檢測

    5. 數(shù)據(jù)分析

    樣品預處理方法

    為了避免樣品中RNA降解,需對樣品進行預處理。

    樣品類型

    處理方法

    送樣量

    貼壁細胞

    倒出培養(yǎng)液,用 1×PBS 清洗一次。
    10 cm2生長的培養(yǎng)細胞中加入 1-2 ml trizol,輕微晃動,確保使裂解液均勻分布于細胞表面。將內含細胞的裂解液轉移至離心管中-80℃保存

    至少1×106個細胞

    懸浮細胞

    將懸浮培養(yǎng)細胞連同培養(yǎng)液一起倒入離心管中,8,000 g 4℃離心2 分鐘,棄上清。
    向細胞中加入 1 ml trizol-80℃保存

    至少1×106個細胞

    組織(動物器官類)

    離心管中加1 ml trizol,確保浸沒組織,-80℃保存

    至少20mg,約小黃豆大小

     

    檢測流程:

    1. 樣品總RNA提取

    2. RNA質量檢測,檢測RNA純度及完整度,提供RNA質量報告;

    3. cDNA合成,使用逆轉錄酶,將樣品RNA逆轉錄為cDNA

    4. 實時定量PCR反應;

    5. 數(shù)據(jù)分析,計算PCR芯片中的各個Ct值,采用ΔΔCt方法比較基因的表達變化,并利用公司自主開發(fā)的數(shù)據(jù)分析軟件進行比較。

     

    基因列表 

    hsa_circ_0001445

    hsa_circ_0001189

    hsa_circ_0003222

    hsa_circ_0001283

    hsa_circ_0002111

    hsa_circ_0002260

    hsa_circ_0003707

    hsa_circ_0001824

    hsa_circ_0004458

    hsa_circ_0024108

    hsa_circ_0006022

    hsa_circ_0001875

    hsa_circ_0004771

    hsa_circ_0036722

    hsa_circ_0006633

    hsa_circ_0004619

    hsa_circ_0015278

    hsa_circ_0058106

    hsa_circ_0014717

    hsa_circ_0006054

    hsa_circ_0021553

    hsa_circ_0058107

    hsa_circ_0047905

    hsa_circ_0006528

    hsa_circ_0064557

    hsa_circ_0007874

    hsa_circ_0054971

    hsa_circ_0008717

    hsa_circ_0067103

    hsa_circ_0000130

    hsa_circ_0057104

    hsa_circ_0008945

    hsa_circ_0078738

    hsa_circ_0000497

    hsa_circ_0058766

    hsa_circ_0018293

    hsa_circ_0079891

    hsa_circ_0001649

    hsa_circ_0060108

    hsa_circ_0005273

    hsa_circ_0016347

    hsa_circ_0001727

    hsa_circ_0063561

    hsa_circ_0007158

    hsa_circ_0013339

    hsa_circ_0003570

    hsa_circ_0069131

    hsa_circ_0041103

    hsa_circ_0000284

    hsa_circ_0004018

    hsa_circ_0081146

    hsa_circ_0061265

    hsa_circ_0023404

    hsa_circ_0005075

    hsa_circ_0084720

    hsa_circ_0082582

    hsa_circ_0013958

    hsa_circ_0005986

    hsa_circ_0085553

    hsa_circ_0002768

    hsa_circ_0003028

    hsa_circ_0000594

    hsa_circ_0089548

    hsa_circ_0075825

    hsa_circ_0007915

    hsa_circ_0004383

    hsa_circ_0091742

    hsa_circ_0075828

    hsa_circ_0013255

    hsa_circ_0000026

    hsa_circ_0138960

    hsa_circ_0075829

    hsa_circ_0054345

    hsa_circ_0000140

    hsa_circ_0000069

    hsa_circ_0004136

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    hsa_circ_0000181

    hsa_circ_0020397

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    hsa_circ_0070963

    hsa_circ_0000190

    hsa_circ_0000098

    hsa_circ_0035381

    hsa_circ_0071410

    hsa_circ_0000745

    hsa_circ_0000732

    hsa_circ_0058058

    hsa_circ_0072088

    hsa_circ_0001895

    hsa_circ_0000893

     

    hsa_circ_0072765

    hsa_circ_0003159

    hsa_circ_0000911

     

     

    更多芯片基因列表可上www.pcrarray.cn查詢

     

    參考文獻

    Zhu J J, Liu Y F, Zhang Y P, et al. VAMP3 and SNAP23 mediate the disturbed flow-induced endothelial microRNA secretion and smooth muscle hyperplasia[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2017, 114(31): 8271-8276. (IF9.661)

    Zheng H S, Guo W Q, Wu Q L, et al. Electro-peroxone pretreatment for enhanced simulated hospital wastewater treatment and antibiotic resistance genes reduction[J]. Environment international, 2018, 115: 70-78. (IF7.088)

    Pu C, Liu H, Ding G, et al. Impact of direct application of biogas slurry and residue in fields: In situ analysis of antibiotic resistance genes from pig manure to fields[J]. Journal of Hazardous Materials, 2018, 344: 441-449.IF6.065

    公司地址:

    城北路1355號上海大學科技園A901

    Q     Q:  2850925266 / 2850925265

    電    話:

    0212-63935065

     

     

    官    網(wǎng):

    www.wcgene.com

     

     

     

     

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  • 實驗管理
  • 2019-03-29
  • 醫(yī)學檢驗
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