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資料介紹

PCR ARRAY介紹

PCR ARRAY又稱PCR芯片，運(yùn)用高通量熒光定量PCR方法，在一張96孔或384孔板上同時(shí)對某個(gè)信號通路或疾病相關(guān)基因的表達(dá)量變化進(jìn)行檢測，芯片上的基因包括了與研究對象有確定關(guān)系的基因或者待考證的基因；目前啟因生物針對不同的信號通路和疾病相關(guān)基因設(shè)計(jì)了150多款功能分類PCR芯片，涵蓋生命科學(xué)研究的各個(gè)領(lǐng)域。

人腫瘤lncRNA PCR芯片介紹

啟因生物的人腫瘤lncRNA PCR ARRAY含有84個(gè)人腫瘤lncRNA 相關(guān)基因，包括：乳腺癌，肺癌，卵巢癌，神經(jīng)母細(xì)胞瘤，黑色素瘤，膽囊癌等數(shù)十種腫瘤或癌癥類型。

產(chǎn)品說明

產(chǎn)品名稱	人腫瘤lncRNA PCR芯片
英文名稱	Human Glucose Metabolism PCR Array
貨號	sp-TWCPAHM-0011
基因數(shù)目	84個(gè)
基因名稱	見基因列表
檢測費(fèi)用	800元/樣(活動(dòng)價(jià)）
樣本類型	細(xì)胞，組織等
項(xiàng)目周期	2周（不含節(jié)假日）
實(shí)驗(yàn)結(jié)果	原始數(shù)據(jù)，數(shù)據(jù)分析
技術(shù)原理	*相對定量，SYBR Green法

*相對定量：用于測定一個(gè)測試樣本中目標(biāo)基因與校正樣本中同一基因表達(dá)的相對變化。校正樣本可以是一個(gè)未經(jīng)處理的對照或者是在一個(gè)實(shí)驗(yàn)研究中處于零時(shí)的樣本。

服務(wù)特點(diǎn)

1. 只需提供樣品

2. 數(shù)據(jù)分析多樣性選擇

3. 中低通量，一次性檢測多個(gè)相關(guān)基因的表達(dá)水平

4. 周期短

5. 結(jié)果不需要qPCR驗(yàn)證

服務(wù)流程

1. 確定實(shí)驗(yàn)方案，簽合同

2. 樣品寄出（-80℃順豐寄出）

3. 收樣后進(jìn)行質(zhì)控

4. 質(zhì)控過關(guān)，上機(jī)檢測

5. 數(shù)據(jù)分析

樣品預(yù)處理方法

為了避免樣品中RNA降解，需對樣品進(jìn)行預(yù)處理。

樣品類型	處理方法	送樣量
貼壁細(xì)胞	①倒出培養(yǎng)液，用 1×PBS 清洗一次。 ② 每 10 cm²生長的培養(yǎng)細(xì)胞中加入 1-2 ml 的trizol，輕微晃動(dòng)，確保使裂解液均勻分布于細(xì)胞表面。③ 將內(nèi)含細(xì)胞的裂解液轉(zhuǎn)移至離心管中，-80℃保存	至少1×10⁶個(gè)細(xì)胞
懸浮細(xì)胞	①將懸浮培養(yǎng)細(xì)胞連同培養(yǎng)液一起倒入離心管中，8,000 g 4℃離心2 分鐘，棄上清。 ② 向細(xì)胞中加入 1 ml 的 trizol，-80℃保存	至少1×10⁶個(gè)細(xì)胞
組織（動(dòng)物器官類）	離心管中加1 ml 的 trizol，確保浸沒組織，-80℃保存	至少20mg,約小黃豆大小

檢測流程：

1. 樣品總RNA提取

2. RNA質(zhì)量檢測，檢測RNA純度及完整度，提供RNA質(zhì)量報(bào)告；

3. cDNA合成，使用逆轉(zhuǎn)錄酶，將樣品RNA逆轉(zhuǎn)錄為cDNA；

4. 實(shí)時(shí)定量PCR反應(yīng)；

5. 數(shù)據(jù)分析，計(jì)算PCR芯片中的各個(gè)Ct值，采用ΔΔCt方法比較基因的表達(dá)變化，并利用公司自主開發(fā)的數(shù)據(jù)分析軟件進(jìn)行比較。

數(shù)據(jù)圖
	火山圖——是在一張圖中利用P值和表達(dá)差異值分析做圖，可以非常的直觀且合理地篩選出在兩樣本間發(fā)生差異表達(dá)的基因。
	維恩圖——不同的實(shí)驗(yàn)組（集合）之間的基因的相互關(guān)系。
	柱狀圖——能夠直觀的反映不同樣本的基因表達(dá)情況的差異。
	散點(diǎn)圖——用兩組數(shù)據(jù)構(gòu)成多個(gè)坐標(biāo)點(diǎn)，考察坐標(biāo)點(diǎn)的分布，判斷兩變量之間是否存在某種關(guān)聯(lián)或總結(jié)坐標(biāo)點(diǎn)的分布模式。
	熱圖——熱圖是對實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)分布情況進(jìn)行分析的直觀可視化方法，可以用來進(jìn)行實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的質(zhì)量控制和差異數(shù)據(jù)的具像化展示，還可以對數(shù)據(jù)和樣品進(jìn)行聚類，觀測樣品質(zhì)量。

基因列表

7SK	DAOA-AS1	IGF2-AS	PCAT19
7SL	DGCR5	IPW	PCGEM1
ASFMR1	DISC2	KCNQ1DN	PDZRN3-AS1
ATP6V1G2-DDX39B	DLEU1	KCNQ1OT1	PISRT1
ATXN8OS	DLEU2	LINC00032	PRINS
BACE1-AS	DLX6-AS1	LINC00162	PTCSC1
BCAR4	DNM3OS	LINC00271	PVT1
BCYRN1	DSCAM-AS1	LSAMP-AS3	RMST
BDNF-AS1	EPB41L4A-AS1	MALAT1	SCAANT1
BOK-AS1	ESRG	MEG3	SNHG11
BPESC1	FMR4	MESTIT1	SNHG3
CASC2	GAS5	MIAT	SNHG4
CBR3-AS1	GDNFOS	MIR100HG	SNHG5
CCAT1	H19	MIR155HG	SOX2-OT
CDKN2B-AS1	HAR1A	MIR17HG	SPRY4-IT1
CECR3	HAR1B	MKRN3-AS1	SRA1
CECR9	HIF1A-AS1	MYCNOS	TCL6
CERNA2	HOTAIR	NAMA	TDRG1
CHL1-AS2	HOXA11-AS	NEAT1	TERC
CRNDE	HYMAI	PCA3	TP53COR1
CUDR	IFNG-AS1	PCAT1	TRAF3IP2-AS1

（更多芯片基因列表可上www.pcrarray.cn查詢）

參考文獻(xiàn)

Zhu J J, Liu Y F, Zhang Y P, et al. VAMP3 and SNAP23 mediate the disturbed flow-induced endothelial microRNA secretion and smooth muscle hyperplasia[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2017, 114(31): 8271-8276. (IF9.661)

Zheng H S, Guo W Q, Wu Q L, et al. Electro-peroxone pretreatment for enhanced simulated hospital wastewater treatment and antibiotic resistance genes reduction[J]. Environment international, 2018, 115: 70-78. (IF7.088)

Pu C, Liu H, Ding G, et al. Impact of direct application of biogas slurry and residue in fields: In situ analysis of antibiotic resistance genes from pig manure to fields[J]. Journal of Hazardous Materials, 2018, 344: 441-449.（IF6.065）

公司地址：	城北路1355號上海大學(xué)科技園A901室
Q Q： 2850925266 / 2850925265
電話：	0212-63935065
官網(wǎng)：	www.wcgene.com

資料大小：

B

所屬類別：

檢測案例

更新日期：

2019-03-20

適用行業(yè)：

醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)

上傳人：

wcgene

標(biāo) 簽：

腫瘤 lncRNA qPCR芯片

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