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嘉峪檢測(cè)網(wǎng) 2022-03-18 13:22
本文主要介紹了蘇州云泰生物醫(yī)藥科技有限公司研發(fā)的醫(yī)療器械“白血病相關(guān)15種融合基因檢測(cè)試劑盒(熒光RT-PCR法)”的臨床前研發(fā)實(shí)驗(yàn)。
一、白血病相關(guān)15種融合基因檢測(cè)試劑盒(熒光RT-PCR法)的產(chǎn)品主要組成成分
表 1 試劑盒主要組成成分
二、白血病相關(guān)15種融合基因檢測(cè)試劑盒(熒光RT-PCR法)的產(chǎn)品預(yù)期用途
本試劑盒用于體外定性檢測(cè)急性髓系白血病(AML)、急性淋巴細(xì)胞白血病(ALL)、以及其他混合表型白血病和前期診斷未明確分型的白血病患者骨髓樣本中的BCR-ABL、SIL-TAL1、E2AHLF、TEL-AML1、MLL-AF4、E2A-PBX1、AML1-ETO、MLLAF9、PML-RARα、MLL-AF6 、MLL-AF10、MLL-ELL、MLLENL、CBFβ-MYH11和DEK-CAN共15種白血病相關(guān)融合基因 (其中MLL-AF6 、MLL-AF10、MLL-ELL和MLL-ENL四種融合基因不能鑒別分型)。
本產(chǎn)品用于輔助白血病診斷與分型、臨床藥物的選擇及評(píng)估疾病預(yù)后。
本產(chǎn)品通過對(duì)臨床骨髓標(biāo)本中的白血病相關(guān)融合基因的 RNA逆轉(zhuǎn)錄后,對(duì)相應(yīng)的 cDNA 進(jìn)行定性檢測(cè),以確定其融合基因的類型,從而及時(shí)輔助白血病臨床診斷、臨床藥物的選擇及評(píng)估疾病預(yù)后提供重要信息。本試劑盒檢測(cè)結(jié)果僅供臨床參考,不得作為臨床診斷的唯一標(biāo)準(zhǔn)。建議結(jié)合患者臨床表現(xiàn)和其他實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)對(duì)病情進(jìn)行綜合分析。
三、白血病相關(guān)15種融合基因檢測(cè)試劑盒(熒光RT-PCR法)的包裝規(guī)格
20測(cè)試/盒
四、白血病相關(guān)15種融合基因檢測(cè)試劑盒(熒光RT-PCR法)的產(chǎn)品檢驗(yàn)原理
本產(chǎn)品由白血病相應(yīng)融合基因特異性引物、熒光探針、RT酶及Taq酶等成分組成,采用核酸擴(kuò)增技術(shù)結(jié)合熒光標(biāo)記探針雜交方法,通過熒光信號(hào)的變化,利用熒光標(biāo)記定性檢測(cè)人骨髓標(biāo)本中的白血病相關(guān)融合基因RNA的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物cDNA。本試劑盒還使用尿苷酶(UNG)防污染體系,經(jīng)加熱可選擇性地降解U-DNA,以防止先前PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的污染;采用內(nèi)參基因(ABL1),控制整個(gè)試劑盒檢測(cè)過程的有效性。
五、白血病相關(guān)15種融合基因檢測(cè)試劑盒(熒光RT-PCR法)的主要原材料的選擇
本試劑盒主要原材料包括:本產(chǎn)品在制備過程中主要原材料包括陽性對(duì)照原液、引物和探針、Taq酶、UNG酶、RT酶和RNasin酶。其中引物、探針為云泰生物自行設(shè)計(jì)后由專業(yè)的合成公司合成,陽性對(duì)照原液為企業(yè)自制,其他原材料均為外購方式獲得。云泰生物選擇有資質(zhì)的供應(yīng)商提供的原料,通過功能性試驗(yàn),篩選出最佳原材料和供應(yīng)商,并制定了各主要原材料的質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)并經(jīng)檢驗(yàn)合格。
七、白血病相關(guān)15種融合基因檢測(cè)試劑盒(熒光RT-PCR法)的企業(yè)參考品設(shè)置情況
云泰生物設(shè)計(jì)了完整的企業(yè)參考品, 包括準(zhǔn)確性參考品、分析特異性參考品、檢測(cè)限參考品和精密度參考品。其中:準(zhǔn)確性參考品共 28 份,包括檢定合格的相應(yīng)白血病融合基因陽性假病毒或內(nèi)參基因假病毒,RNA濃度為3×104 copies/μL。分析特異性參考品共3 份,包括骨髓細(xì)胞裂解物、HL60細(xì)胞株裂解物、 Jurkat細(xì)胞株裂解物各1份,抽提為RNA,RNA濃度為3×104 copies/μL。檢測(cè)限參考品共18份,包括檢定合格的相應(yīng)白血病融合基因陽性假病毒或內(nèi)參基因假病毒,抽提為RNA后配制,終濃度為每種RNA 800 copies/μL。精密度參考品共10份,包括檢定合格的相應(yīng)白血病融合基因陽性假病毒或內(nèi)參基因假病毒,抽提為RNA后配制,高濃度精密度的終濃度為每種RNA 2×104 copies/μL,低濃度精密度的終濃度為每種RNA 2×103 copies/μL。
八、白血病相關(guān)15種融合基因檢測(cè)試劑盒(熒光RT-PCR法)的生產(chǎn)工藝及反應(yīng)體系研究
云泰生物通過對(duì)試劑主要生產(chǎn)工藝的研究,確定了最佳生產(chǎn)工藝。云泰生物對(duì)反應(yīng)體系中的引物、探針的組合;引物濃度、探針濃度;緩沖液的選擇;Taq酶、UNG酶用量;退火溫度,退火時(shí)間,反應(yīng)循環(huán)數(shù),變性溫度和時(shí)間;樣本的上樣量,抽提方法的選擇;樣本提取RNA質(zhì)量要求;融合基因組合檢測(cè)的設(shè)置等進(jìn)行篩選和優(yōu)化。通過功能性試驗(yàn),最終確定了最佳反應(yīng)體系。
九、白血病相關(guān)15種融合基因檢測(cè)試劑盒(熒光RT-PCR法)的分析性能評(píng)估
分析性能包括核酸提取純化、準(zhǔn)確性、精密度、最低檢出限、分析特異性(交叉反應(yīng)和干擾試驗(yàn))的評(píng)估等。云泰生物提交了有效運(yùn)行的質(zhì)量管理體系下生產(chǎn)的三批產(chǎn)品在適用機(jī)型上的性能評(píng)估資料。
在核酸提取純化研究中,云泰生物評(píng)價(jià)了抽提方法的提取效率、提取RNA濃度的重復(fù)性、RNA純度和抗干擾能力,確定了一種抽提試劑盒與該產(chǎn)品配套使用。
在準(zhǔn)確性研究中,云泰生物檢測(cè)企業(yè)準(zhǔn)確性參考品和64例不同融合類型的陽性臨床樣本結(jié)果顯示:陽性符合率均為100%。
在分析特異性研究中,云泰生物檢測(cè)包括3份企業(yè)特異性參考品樣本和8例融合基因陰性的臨床樣本,其陰性符合率為100%。
試劑盒檢測(cè)6例SET-NUP214、NUP98-HOXA9、 TLS-ERG 融合基因陽性白血病患者骨髓血樣本提取的核酸,其陰性符合率為100%。
云泰生物選擇4例融合基因陰性骨髓樣本,通過添加的形式,分別研究HBV 病毒、CMV 病毒、HCV 病毒和EBV 病毒對(duì)檢測(cè)結(jié)果的影響,試驗(yàn)結(jié)果顯示試劑盒不受上述病原體的影響。干擾試驗(yàn)研究結(jié)果表明,輕度溶血的全血樣本(即Hb濃度≤3g/L)、重度脂血的全血樣本(TG濃度為20 mmol/L)、重度黃疸的全血樣本(T-Bil含量為172umol/l)對(duì)檢測(cè)結(jié)果無干擾。2.5倍治療水平濃度的常見藥物和治療白血病的靶向藥物,阿莫西林,阿司匹林、維甲酸、伊馬替尼、阿糖胞苷、長(zhǎng)春新堿、柔紅霉素、亞砷酸、左旋門冬酰胺酶、環(huán)磷酰胺和氟達(dá)拉濱研究結(jié)果顯示藥物對(duì)檢測(cè)結(jié)果無影響。
在精密度研究中,云泰生物采用三批試劑盒,對(duì)各精密度參考品,進(jìn)行批次內(nèi)/間、試驗(yàn)日內(nèi)/間、試驗(yàn)輪次內(nèi)/間、操作者間、實(shí)驗(yàn)室間精密度研究,CV值≤5%。試劑盒對(duì)18例臨床樣本進(jìn)行三批產(chǎn)品的精密度試驗(yàn),均能檢出,且其實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)CV值≤5%。對(duì)15例臨床樣本進(jìn)行20天精密度試驗(yàn),從批次內(nèi)、批次間、不同儀器、試驗(yàn)操作者間、實(shí)驗(yàn)室間精密度進(jìn)行研究,檢測(cè)結(jié)果均能檢出,且其實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)CV值≤5%。
在最低檢出限研究中,云泰生物采用相應(yīng)白血病融合基因陽性樣本或內(nèi)參基因假病毒分別稀釋至10000 copies/反應(yīng)、1000 copies/反應(yīng)、100 copies/反應(yīng)確定試劑盒檢測(cè)限。云泰生物采用覆蓋聲稱靶基因類型的陽性標(biāo)本與陰性樣本稀釋至檢測(cè)限附近進(jìn)行最低檢出限的驗(yàn)證,結(jié)果顯示所有樣本重復(fù)20次,均≥95%檢出。
十、白血病相關(guān)15種融合基因檢測(cè)試劑盒(熒光RT-PCR法)的陽性判斷值
云泰生物采用ROC曲線法確定陽性判斷值。云泰生物采用69個(gè)不同融合基因型陽性樣本和47個(gè)陰性樣本進(jìn)行檢測(cè),建立檢測(cè)試劑的陽性判斷值,云泰生物選取18例白血病相應(yīng)15種融合基因陽性和10例相應(yīng)15種融合基因陰性共28 例臨床診斷結(jié)果明確的標(biāo)本來驗(yàn)證試劑盒的準(zhǔn)確性。檢測(cè)結(jié)果顯示建立的陽性判斷值可以滿足試劑盒對(duì)于臨床樣本準(zhǔn)確性的要求。
云泰生物選取125例臨床樣本,包含覆蓋聲稱靶基因陽性樣本、檢測(cè)融合基因范圍外的融合類型陽性樣本和融合基因陰性樣本。
對(duì)建立的陽性判斷值進(jìn)行驗(yàn)證。檢測(cè)結(jié)果顯示建立的陽性判斷值可以滿足試劑盒對(duì)于臨床樣本的檢測(cè)。最終確定以下判讀方法:因不同反應(yīng)液、不同熒光通道檢測(cè)不同的融合基因,因此,每個(gè)樣本在分析中,必須逐一對(duì)不同的反應(yīng)液、同一反應(yīng)液中的不同通道分別分析,即必須逐一將樣本、陽性對(duì)照、陰性對(duì)照同時(shí)分析其在各個(gè)反應(yīng)液中的三種熒光擴(kuò)增曲線。
表 2 判讀方法
*樣本內(nèi)參CT值指PCR反應(yīng)液6 CY5熒光通道CT值。
**反應(yīng)液融合基因CT值指除PCR反應(yīng)液6 CY5熒光通道以外其他熒光通道CT值。
若出現(xiàn)陽性結(jié)果,具體融合基因型參照下表。
表3 相關(guān)融合基因?qū)?yīng)表
十一、白血病相關(guān)15種融合基因檢測(cè)試劑盒(熒光RT-PCR法)的穩(wěn)定性研究
云泰生物對(duì)本產(chǎn)品的實(shí)時(shí)穩(wěn)定性、凍融穩(wěn)定性等進(jìn)行了研究,確定了在各種條件下本產(chǎn)品的有效保存時(shí)間。同時(shí),分別對(duì)骨髓樣本和抽提后的RNA保存條件、凍融時(shí)間及凍融次數(shù)進(jìn)行了研究確定了臨床樣本的保存條件。
實(shí)時(shí)穩(wěn)定性研究:將三批試劑盒在-20℃±4℃冰箱中儲(chǔ)存0、10、15、18個(gè)月后分別進(jìn)行一次成品檢驗(yàn),結(jié)果表明試劑盒在常規(guī)儲(chǔ)存條件下18個(gè)月后檢測(cè)結(jié)果均符合技術(shù)要求,故本試劑盒常
規(guī)穩(wěn)定性定為:儲(chǔ)存條件-20℃±4℃,儲(chǔ)存18個(gè)月。
凍融次數(shù)研究:使用一批試劑盒進(jìn)行開蓋試驗(yàn),具體操作流程如下:在-20℃±4℃冰箱中存放的試劑盒2盒,每5天左右拿出一次,將試劑完全融解后,將試劑完全融解,開蓋2分鐘后再蓋好蓋子,放回-20℃±4℃冰箱中存放,每5天左右重復(fù)一次,連續(xù)5次,1個(gè)月后進(jìn)行檢定,試劑盒準(zhǔn)確性、特異性、檢測(cè)限性能穩(wěn)定,因此將試劑盒開蓋、反復(fù)凍融條件定為:有效期內(nèi)反復(fù)凍融4次,性能穩(wěn)定。
來源:嘉峪檢測(cè)網(wǎng)