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金黃色葡萄球菌食物中毒的實驗室診斷常通過檢測剩余食品，根據金黃色葡萄球菌數量達到105cfu/g以上，或者檢出腸毒素來判定。

1、常規細菌培養法

目前，從食品中檢測金黃色葡萄球菌的常規細菌培養方法( GB 4789.10-2010《食品微生物學檢驗金黃色葡萄球菌檢驗》) ，可對食品中金黃色葡萄球菌進行定性和定量檢驗，該方法設備簡單、成本低; 但檢驗時間較長( 3 ～ 5d) ，操作繁瑣，且靈敏度較低; 不宜應對突發性公共衛生和食物中毒事件中篩檢出金黃色葡萄球菌。

2、免疫學方法

金黃色葡萄球菌有多種蛋白質抗原，其中腸毒素和金黃色葡萄球菌A蛋白常用于金黃色葡萄球菌的檢測。金黃色葡萄球菌免疫學檢測方法有免疫熒光技術、酶聯免疫( ELISA) 技術、乳膠凝集技術和免疫磁珠技術等，主要用于腸毒素的測定。如直接從食品中檢測腸毒素的ELISA、反向被動乳膠凝集等，檢測限可達到ng/g(ml) 。同時，免疫學方法的一些缺陷削弱其應用，如需要高純度的腸毒素制備特異性抗體，而純化腸毒素是比較困難和昂貴的，到目前僅SEA～SEE、SEG、SEH和SelQ抗體得到廣泛使用，同時一些試劑盒特異性較低，可因食品成分干擾出現假陽性。

3、分子生物學方法

近年來，以分子生物學為基礎的PCR方法和實時熒光定量PCR方法等廣泛用于食品中金黃色葡萄球菌的快速檢測，具有特異性強、靈敏度高、檢測限低等優點，無需增菌就可從基因水平直接檢測金黃色葡萄球菌，可以克服傳統細菌培養法的缺點和不足。

（1）1PCR方法

PCR方法檢測金黃色葡萄球菌所選用的靶基因主要有腸毒素基因、耐熱核酸酶基因、凝固酶基因、抗生素抗性基因和16SrNA基因等，而用于食品中檢測的靶基因常用腸毒素基因和耐熱核酸酶基因。在2000 年日本發生的因奶粉被金黃色葡萄球菌腸毒素污染造成13000多人食物中毒的事件中，盡管從毒奶粉中未分離到金黃色葡萄球菌，然而采用PCR方法檢出了sea，seg，seh和sei腸毒素基因。近年來一些研究者在同一反應體系中使用一通用引物和不同特異性引物檢測金黃色葡萄球菌多種毒力基因的多重PCＲ 方法，其實用性較好。Kim等采用該方法分析了從即食冷凍食品中分離的金黃色葡萄球菌腸毒素基因( sea、seb、sec、sed、see、seg、she、sei 和sej)、毒性休克綜合征毒素-1 基因( tst-1) 和2 種表皮剝落毒素基因(eta和etb)，約一半的菌株有產毒特性，大部分產毒菌株具有編碼兩種及以上毒素的基因，產毒基因出現頻率依次為seg=sei＞sea＞tst-1＞etb＞seh＞eta＞sec＞sej。在使用PCR檢測腸毒素基因時，研究者發現金黃色葡萄球菌攜帶腸毒素基因的可變性高(75%～80%)，它是因為金黃色葡萄球菌的基因組含有多種IS元件、原噬菌體序列和致病基因島等可移動元件，而在可移動遺傳元件上編碼許多腸毒素，這些可移動元件的轉移致使金黃色葡萄球菌腸毒素呈多樣性以及新腸毒素基因和高致病力毒株的不斷出現。

（2）實時熒光定量PCR方法

采用PCR方法可對金黃色葡萄球菌進行快速診斷，但不能對其準確定量，同時容易產生交叉污染、出現假陽性等。而在普通PCR方法基礎之上發展起來的實時熒光定量PCR，克服了普通PCR方法的缺陷，目前已在食品中金黃色葡萄球菌檢測方面得到應用。CHIANG 等采用實時熒光PCR檢測奶和肉樣品中的金黃色葡萄球菌，方法檢出限為103cfu/ml或cfu/g; 如樣品經10h增菌，檢出限可達到1cfu/ml或cfu/g。

4、質譜分析

由于現有金黃色葡萄球菌檢測方法的缺陷，以及對新的腸毒素缺乏可利用的抗體，為此一些研究人員建立了基于物理化學技術的分析方法，如基質輔助激光解吸-電離飛行時間質譜法，它是基于腸毒素作為金黃色葡萄球菌的特征性生物標志物，將樣品在基質輔助下檢測，得到含腸毒素分子量和結構信息的質譜圖，與蛋白質組數據庫中的質譜圖比較，來判斷食品是否被金黃色葡萄球菌污染。該方法具有定量、特異、快速和可靠的特點。

5、生物傳感器檢測法

近年來，生物傳感器技術應用于金黃色葡萄球菌腸毒素檢測，它具有所需樣品量少、速度快、生物功能膜可多次使用等優點。目前主要有電化學免疫傳感器、光學生物傳感器和壓電晶體免疫傳感器等，基于單壁碳納米管的生物傳感器可實時監控樣品中金黃色葡萄球菌的污染，最低檢測濃度達到8×102cfu/ml。