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基因過表達(dá)實(shí)驗(yàn)流程——從病毒制備到細(xì)胞感染

嘉峪檢測(cè)網(wǎng)        2024-10-22 08:22

轉(zhuǎn)染是細(xì)胞生物學(xué)研究的重要技術(shù),是指將外源性的DNA、RNA等導(dǎo)入目的細(xì)胞的過程,主要用于調(diào)控基因表達(dá),從而研究基因功能。以下以研究腎缺血再灌注損傷模型中慢病毒包裝過表達(dá)腎小管上皮細(xì)胞(HK-2細(xì)胞)線粒體分裂基因drp1為例介紹轉(zhuǎn)染相關(guān)實(shí)驗(yàn)步驟。

 

一、質(zhì)粒提取(輔助質(zhì)粒PMD2.G、PSPAX2,目的質(zhì)粒)

 

實(shí)驗(yàn)步驟:

 

1、配制LB固體培養(yǎng)基(加氨芐):胰蛋白胨10g,酵母提取物5g,NaCl 10g,瓊脂粉15g,加入1000 mL水。需高壓滅菌,待溫度降至40-50℃時(shí),加入適量氨芐,混勻后倒板。

 

2、劃線:待板中培養(yǎng)基冷卻至室溫后,將接種環(huán)用酒精燈滅菌后在酒精燈周圍蘸取菌液并依次劃線,然后置于37℃培養(yǎng)箱培養(yǎng)。

 

3、搖菌:挑去板中出現(xiàn)的單個(gè)菌落至裝有15 mL LB液體培養(yǎng)基的離心管中,瓶蓋適當(dāng)擰松,置于37℃搖床上200rpm 12-16h。

 

4、離心:將含有菌液的離心管1000rpm,室溫離心5min。

 

5、提取:棄去離心管中菌液,用質(zhì)粒提取試劑盒進(jìn)行質(zhì)粒提取。

 

6、測(cè)濃度:用分光光度計(jì)測(cè)取各提取質(zhì)粒濃度,用于后續(xù)實(shí)驗(yàn)。

 

注意事項(xiàng):

 

1、配制LB固體培養(yǎng)基加入氨芐時(shí),需控制好溫度。溫度過高,會(huì)使得氨芐失去活性;溫度過低,則會(huì)使氨芐混合不均勻,且容易凝固。通常情況下,以手能握住玻璃瓶15s為宜。

 

2、常用氨芐濃度為100mg/mL,加入量為100μL/100mL。

 

3、LB固體培養(yǎng)基與液體培養(yǎng)基配制的區(qū)別在于是否加入瓊脂粉。

 

4、劃線通常采用四區(qū)劃線法,每個(gè)區(qū)不能有重疊,首尾不能接觸,逐漸稀釋以便于長(zhǎng)出所需的單個(gè)菌落。

 

5、劃線時(shí),注意不能劃破瓊脂培養(yǎng)基,以防止造成污染。

 

6、劃線結(jié)束后,長(zhǎng)出單個(gè)菌落即可挑菌,若菌落太小,可適當(dāng)延長(zhǎng)培養(yǎng)時(shí)間;若時(shí)間過長(zhǎng),可能導(dǎo)致交叉污染。

 

7、須挑取單個(gè)菌落,不可挑去多個(gè)單菌落,這樣會(huì)導(dǎo)致提取的質(zhì)粒純度降低,進(jìn)而影響轉(zhuǎn)染效率。

 

8、搖菌時(shí),不可時(shí)間過長(zhǎng),以12-16h為宜,太長(zhǎng)可能會(huì)造成菌體變異;時(shí)間太短,會(huì)影響質(zhì)粒提取效果。

 

二、轉(zhuǎn)染步驟

 

實(shí)驗(yàn)步驟:

 

1、293T細(xì)胞準(zhǔn)備:復(fù)蘇293T于培養(yǎng)瓶中,觀察293T狀態(tài)至傳代至少3次。傳代后的293T長(zhǎng)滿后傳至培養(yǎng)瓶中,繼續(xù)培養(yǎng)并觀察細(xì)胞狀態(tài)。

 

2、換液:培養(yǎng)瓶中293T密度達(dá)70-80%時(shí),提前1h換液。

 

3、轉(zhuǎn)染復(fù)合物配制:A液:3μg PSPAX2 ;1.5 μg PMD2.G;3μg Target,用無血清DMEM培養(yǎng)基或Opti-MEM培養(yǎng)基補(bǔ)齊至1.5mL。B液:加入22.5μL PEI(1μg/μL)至1.5mL無血清DMEM培養(yǎng)基或Opti-MEM培養(yǎng)基。

 

4、靜置:A,B液分別配好后,室溫靜置5min。

 

5、混合:將B液緩慢懸空滴加至A液,順序不可反。

 

6、靜置:混合后,室溫靜置20min。

 

7、轉(zhuǎn)染:棄去293T培養(yǎng)瓶中的培養(yǎng)基,將上述混合緩慢加入293T細(xì)胞。

 

8、換液:6h后棄去混合液,換成293T細(xì)胞正常培養(yǎng)基培養(yǎng)。

 

注意事項(xiàng):

 

1、轉(zhuǎn)染前,要確保293T細(xì)胞狀態(tài),否則影響轉(zhuǎn)染效率。

 

2、新復(fù)蘇的293T狀態(tài)欠佳,不利于轉(zhuǎn)染,至少3代以后。

 

3、轉(zhuǎn)染前293T密度不能過大,太滿后續(xù)容易飄;密度過低則影響產(chǎn)毒效率。

 

4、轉(zhuǎn)染復(fù)合物配制因細(xì)胞系及自身經(jīng)驗(yàn)可能不同。

 

5、加入B液時(shí),必須緩慢滴加。

 

6、換液時(shí),動(dòng)作要輕柔,不可對(duì)著293T細(xì)胞。

 

三、病毒收集

 

實(shí)驗(yàn)步驟:

 

1、24h收集病毒:換液后24h收集病毒至15ml離心管中,并更換新的培養(yǎng)基(含血清不含雙抗DMEM培養(yǎng)基),并將收集到的病毒置于4℃。

 

2、48h收集病毒:48h后再次收集病毒至上述離心管中,置于4℃冰箱。

 

3、配制病毒濃縮液:即5× PEG 8000,NaCl 8.766g+PEG 8000 50g,溶于200mL純水,高溫高壓滅菌,保存于4℃。

 

4、離心:將收集到的病毒4℃,3000rpm,離心15min,去除細(xì)胞碎片。

 

5、過濾:用注射器吸取上清,用0.45μM濾膜過濾至15mL離心管中。

 

6、濃縮:用移液槍吸取PEG8000,向病毒液中加入1/4體積的5× PEG8000,并立即顛倒混勻,置于4℃。每30min顛倒5-10次,總共操作5-6次。

 

7、靜置:于4℃靜置過夜,白色沉淀物即為病毒。

 

8、離心:4℃,4000g,離心20min。

 

9、重懸:棄去上清,用適量冷PBS或無血清DMEM培養(yǎng)基重懸,并分裝至1.5mL EP管中。

 

10、存放:將分裝好的病毒液放至-80℃冰箱保存,或者用于后續(xù)實(shí)驗(yàn)。

 

注意事項(xiàng):

 

1、收集病毒時(shí),含血清不含雙抗的培養(yǎng)基產(chǎn)毒效率較高。

 

2、兩次收集的毒液可混合,也可分開,一般48h產(chǎn)毒較多。

 

3、離心機(jī)離心前,均需預(yù)冷。

 

4、棄上清時(shí),動(dòng)作要輕柔,避免吸到病毒。

 

四、感染目的細(xì)胞

 

實(shí)驗(yàn)步驟:

 

1、準(zhǔn)備HK-2細(xì)胞:將生長(zhǎng)狀態(tài)較好的HK-2細(xì)胞傳至新培養(yǎng)瓶中,觀察細(xì)胞狀態(tài)及密度。

 

2、換液:待HK-2細(xì)胞密度為50-70%時(shí),給細(xì)胞換液。

 

3、加毒:向病毒液中加入ploybrene ,混合后加至目的細(xì)胞中,并使ploybrene終濃度達(dá)8μg/mL,混勻后放入培養(yǎng)箱培養(yǎng)。

 

4、換液:24h后,更換新的DMEM-F12培養(yǎng)基(含血清+雙抗)。

 

5、篩選:繼續(xù)培養(yǎng)24h后,進(jìn)行帶抗性的穩(wěn)轉(zhuǎn)株篩選。

 

6、驗(yàn)證:用熒光顯微鏡或WB、PCR驗(yàn)證效果。

 

注:由于篇幅有限,步驟5、6本文不作詳細(xì)講解。

 

注意事項(xiàng):

 

1、感染前,要確保目的細(xì)胞活性及密度。

 

2、Ploybrene濃度因細(xì)胞系及經(jīng)驗(yàn)不同可能不同。

 

3、待細(xì)胞活性恢復(fù)后,再進(jìn)行篩選。

 

4、若有熒光對(duì)照,可根據(jù)熒光判斷轉(zhuǎn)染的效率;但HK-2細(xì)胞系的drp1過表達(dá)效果還需WB、PCR等做進(jìn)一步驗(yàn)證。

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來源:實(shí)驗(yàn)老司機(jī)

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